Pada tahun 1963, datang permintaan mendesak dari Mgr. A. Djajaseputra, Sj agar FIC membuka sekolah. Menanggapi permintaan tersebut, FIC membuka karya pendidikan SMA Putra Kebayoran, dan pada tahun 1965 resmi Sekolah Menengah Atas mulai beroperasi.


Setelah sekolah Pangudi Luhur di Jakarta berkembang pesat, maka datanglah permintaan baru dari lingkungan Cipete, agar para Bruder FIC mendirikan sekolah TK dan SD. Segera dibentuklah panitia pendirian sekolah yang anggotanya antara lain Bpk. Drs. G. Sugiharso. Dengan restu dari Bpk. Gubernur Ali Sadikin dan Nyonya, akhirnya bulan Juli 1973 sekolah TK dan SD Pangudi Luhur dapat dibangun dengan bantuan pemerintah DKI dan diresmikan oleh Bapak Gubernur Ali Sadikin.


Sejak semula SD Pangudi Luhur didirikan untuk mendidik anak-anak agar mereka dapat belajar dengan baik sekaligus menanamkan nilai-nilai iman Kristiani.